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宁夏破解银柴胡“基因密码” 获国际首个染色体水平参考基因组
2026-05-13 11:09:51 来源:宁夏日报客户端

  被誉为“清虚热良药”的道地中药材银柴胡,其遗传密码首次被宁夏科研团队成功破译。5月12日,记者从宁夏农林科学院获悉,该院生物中心特色植物开发与利用研究团队在国际知名期刊《植物科学前沿》上发表研究成果,我区首次获得银柴胡染色体级别的高质量参考基因组,这也是国际期刊首次刊出的对银柴胡染色体水平高质量参考基因组的研究成果。这一成果为推动银柴胡全基因组遗传信息揭示、种质资源保护与创新、主要活性成分生物合成等研究奠定了重要基础。

  银柴胡是石竹科繁缕属植物,其干燥根具有清虚热、除疳热的功效,临床主治阴虚发热、骨蒸劳热、小儿疳热等症。同心县是银柴胡的主产区,该药材已获国家地理标志保护产品认证。然而,长期以来,银柴胡的参考基因组信息一直空白,严重制约了其基础研究和种质创新。研究团队负责人介绍,银柴胡基因组之所以长期未被解析,主要面临几大“拦路虎”:遗传信息“相似但不完全相同”的比例很高,含有大量重复的片段,没有亲缘关系很近的物种可以参考,解读基因功能也十分复杂。

  刊物发表论文上的银柴胡形态展示图。

  为攻克这些难题,团队从2024年开始开展银柴胡野生型和栽培型种质资源收集,人工种植等研究,共收集了319份银柴胡种质资源。此次研究对同心县栽培的银柴胡种质采用最新的三代测序技术组合——用PacBio HiFi技术读取长片段DNA,用Illumina短读长数据纠错,再用Hi-C技术将片段挂载到染色体上。针对高杂合这一核心难点,团队采取巧妙策略,将父母本来源的DNA分开组装,最终获得了两套独立的单倍型基因组。研究最终明确银柴胡基因组大小约1.85Gb,成功组装出14条染色体,包含48391个蛋白编码基因,组装完整性达到95.66%。

  据悉,该研究得到了自治区农业高质量发展和生态保护科技创新示范项目——特色资源植物规范化种植技术研发和自治区重点研发计划项目课题——道地药材银柴胡基因组图谱分析及特异性分子标记开发与应用的资助。(宁夏日报记者 马越/文 图片由受访单位提供)

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